强直性脊柱炎是一种以中轴关节炎症为特点的慢性、进展性疾病，发病机制目前尚不明确。目前的研究表明HLA-B27与强直的出现存在密切关系。HLA-B27是人类主要组织相容性复合体（MHC）Ⅰ类，另外，炎症性肠病是一种较为常见的强直性脊柱炎关节外表现，有观点认为强直性脊柱炎发病与肠道免疫也有关。
HLA-B27在AS发病中起的作用
MHC是免疫细胞识别自我和非我关键的组成，是免疫应答的重要成分，而HLA-B27是MHCⅠ类。HLA-B27引起AS发病的主要机制目前存在三种假说。
1.HLA-B27异常表达
Ⅰ类主要由三个独立多肽组成：即重链、β2微球蛋白轻链、氨基酸锚定残基。其中β2微球蛋白轻链从重链中分离，自由重链结合形成同源二聚体表达在细胞内或细胞表面。而HLA-B27同源二聚体与KIR3DL2结合，激活了Th17细胞，这些被激活的Th17细胞通过淋巴系统达到靶器官，促进这些器官中微生物与自身抗原间的模拟反应，进而产生关节炎症反应。
2.HLA-B27的错误折叠
肽链的错误折叠或未折叠形式蛋白无法传输到细胞膜，累积在内质网上或导致内质网出现应激反应，从而引发关节炎症反应。
3.关节肽假说
某些外源胎与关节组织中的自身胎结构相似，这种特定的相似自身肽被HLA-B27并激发某种细胞产生自应性免疫反应，对自生组织进行进攻，从而引发炎症。但目前研究至今尚未识别到能触发AS免疫反应的“关节基因肽”，而在与AS相关或非相关的HLA-B27亚型结合肽之间也未发现有定性差异。
肠道免疫在AS发病中起的作用
炎症性肠病是较为常见的一种强直性脊柱炎的关节外表现，研究观点认为，炎症性肠病和强直性脊柱炎存在互相影响的关系。肠道微生物是外源微生物与HLA-B27相互作用的一个重要方面。研究调查的数据显示AS患者并发IBD者占5%～10%，还有超过70%的AS患者伴有亚临床肠道炎症，高到30%的IBD患者可能发生关节炎症反应。AS和IBD相互影响，这表明二者可能有相似的发病机制。国外学者认为，肠道菌群失衡可能是AS发病和肠道炎症的共同发病机制。虽然AS患者肠道菌群失调与固有的免疫反应及慢性炎症被研究认为可能存在关系，但二者的因果关系仍需要进一步研究确定。
